丹波黒は在来品種であることから現在の奨励品種の枠組みでは指定する状況になく奨励品種から外れているが、農協単位での種子生産や、県が優良系統として技術センターで種を確保し農協に供給するなど種子生産と品質維持に取り組んでいる。